熒光定量技術(shù)服務項目介紹
Real Time PCR法是實時監(jiān)測解析PCR擴增量的方法。因其無需電泳,大大減低了實驗污染的機率,且具有快速、可對檢測靶基因定量而倍受青睞。實時熒光定量PCR避免了傳統(tǒng)PCR以終產(chǎn)物檢測定量產(chǎn)生的偏差,提高實驗的重復性。該技術(shù)已被廣泛用于檢測細胞、細菌等mRNA表達量的變化;比較不同組織的mRNA表達差異;驗證基因芯片,siRNA干擾的實驗結(jié)果。我們?yōu)槟峁┤讓崟r熒光定量PCR技術(shù)及解析服務:您只需提供組織或細胞標本,我們?yōu)槟瓿蒖NA抽提,cDNA制備,實時定量PCR,標準曲線制備及數(shù)據(jù)分析的所有步驟。
一、配套設備
1、熒光定量PCR儀
ABI 7900熒光定量PCR儀
Lightcycler 240熒光定量PCR儀
2、離心機
Heras低溫高速離心機
Beckman低溫高速離心機
二、檢測方法
1、TaqMan探針方法
該技術(shù)以美國 ABI 公司為代表。 PCR 擴增時,在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針。該探針為一直線型的寡核苷酸片斷,兩端分別標記一個熒光報告基團和一個熒光淬滅基團,在TaqMan探針法的定量PCR反應體系中,包括一對PCR引物和一條探針。探針只與模板特異性地結(jié)合,其結(jié)合位點在兩條引物之間。探針的5′端標記有報告基團(Reporter, R),如FAM、VIC等,3′端標記有熒光淬滅基團(Quencher, Q),如TAMRA等。當探針完整的時候,報告基團所發(fā)射的熒光能量被淬滅基團吸收,儀器檢測不到信號。隨著PCR的進行,Taq酶在鏈延伸過程中遇到與模板結(jié)合的探針,其3′→5′外切核酸酶活性就會將探針切斷,報告基團遠離淬滅基團,其能量不能被吸收,即產(chǎn)生熒光信號(圖4)。所以,每經(jīng)過一個PCR循環(huán),熒光信號也和目的片段一樣,有一個同步指數(shù)增長的過程。信號的強度就代表了模板DNA的拷貝數(shù)。
2、SYBR Green I嵌合熒光法
SYBR Green I熒光染料技術(shù)原理:SYBR Green I是一種只與DNA雙鏈結(jié)合的熒光染料(圖2)。當它與DNA雙鏈結(jié)合時,發(fā)出熒光;從DNA雙鏈上釋放出來時,熒光信號急劇減弱。因此,在一個體系內(nèi),其信號強度代表了雙鏈DNA分子的數(shù)量。SYBR Green熒光染料法定量PCR的基本過程是:1、開始反應,當SYBR Green染料與DNA雙鏈結(jié)合時發(fā)出熒光。2、DNA變性時,SYBR Green染料釋放出來,熒光急劇減少。3、在聚合延伸過程中,引物退火并形成PCR產(chǎn)物。4、聚合完成后,SYBR Green染料與雙鏈產(chǎn)物結(jié)合,定量PCR系統(tǒng)檢測到熒光的凈增量加大。
SYBR Green I熒光染料能與所有的DNA雙鏈相結(jié)合,對DNA模板沒有選擇性,所以特異性不如TaqMan探針。要想用熒光染料法得到比較好的定量結(jié)果,對PCR引物設計的特異性和PCR反應的質(zhì)量要求就比較高。在此前提下,本法是一種成本低廉的選擇。
三、服務項目
1、定性分析
PCR反應結(jié)束后的PCR產(chǎn)物無需電泳檢測,可以通過Real Time PCR方法,簡單快速地對目的基因進行高特異性、高靈敏度的檢測,同時閉管操作的實時檢測可以有效防止反應產(chǎn)物的污染。本技術(shù)可以廣泛應用于病毒、病原菌等致病微生物的檢測以及各種生物品種的鑒定等。
2、絕對定量
絕對定量首先必須構(gòu)建與檢測樣品目的基因具有相同序列的標準品。使用已知濃度的標準品制作5 個點以上的標準曲線后,可以使用標準曲線對未知濃度的檢測樣品進行絕對量(起始拷貝數(shù))分析。
3、相對定量(mRNA表達量分析)
基因表達的研究一般采用相對定量的方法。相對定量法必須對樣品的目的基因和參比基因內(nèi)標同時分別進行定量,然后求出對于參比基因的目的基因的相對量。通過對樣品間的目的基因的相對量進行比較,可以對不同樣品間的mRNA進行表達量分析。參比基因通常選用β-actin。通過同時對參比基因的實時檢測,可以對樣品之間由于起始細胞數(shù)不同、或RNA提取效率的不同等造成的RNA量誤差進行校正,達到在嚴格意義上對樣品之間的mRNA表達量進行分析之目的。
四、服務流程
1、 客戶以電話或郵件形式告知公司要進行的實驗基因名稱和標本數(shù)目;
2、 公司派專業(yè)技術(shù)人員與您洽談實驗費用和熒光定量探針設計方案(序列和設計有公司負責);
3、 簽訂實驗技術(shù)服務合同,交費用的30%作為訂金(若實驗沒有結(jié)果或結(jié)果未達到客戶要求,訂金不退);
4、 公司合成熒光定量探針、派相關(guān)人員取回實驗標本;
5、 進行RNA抽提、鑒定、cDNA合成實驗;
6、 進行實時熒光定量PCR實驗(每個標本的每個基因均進行3倍平行孔實驗,保證獲得準確、無誤差、客觀的樣品基因擴增數(shù)據(jù));
7、 通過統(tǒng)計分析軟件計算目的基因的mRNA表達數(shù)據(jù);
8、 提供完整的實驗報告(實時熒光擴增曲線圖、分析數(shù)據(jù)、實驗步驟、試劑儀器);
9、 客戶交齊全額費用。
五、服務要求
1、請認真填寫Real Time PCR檢側(cè)技術(shù)服務委托單;
2、 請您提供新鮮的且盡量多的材料(各種材料的 RNA 提取量請參照“總 RNA 的提取”),或直接提供純化好的總RNA(大于5µg/樣品);(各種材料的 DNA 提取量請參照“ D NA 的提取”),或直接提供純化好的DNA(大于5µg/樣品) ;
3、如果提供的材料為細胞或組織,應保證材料新鮮:
細胞樣品:細胞培養(yǎng)至少達105以上,培養(yǎng)后細胞請勿做任何處理。
組織樣品:離體后30分鐘內(nèi)入液氮保存,動物組織為5mg以上。
血液樣品:分離白細胞后,-70℃保存。
4、 請通過 E-mail 提供已知的全長基因序列;
5、 請?zhí)峁┍M可能詳細的背景資料: DNA/ RNA 來源、豐度等。
六、收費標準及交貨期限
服務內(nèi)容
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樣品數(shù)量
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價格
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相關(guān)要求
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實驗結(jié)果
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探針的設計和篩選(TaqMan法)
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2200元/條
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客戶提供基因序列
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合成好的引物、探針。
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引物的設計和篩選(SybrGreen法)
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700元/條
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客戶提供基因序列
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合成好的引物。
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基因組DNA提取
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1-9個
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100元/個
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組織:新鮮樣品或-70℃保存樣品,避免反復凍融提供樣品量500mg以上,剩下歸還(無致病性,除脂肪組織、粘液狀組織以外)。(新鮮,10mg)
細胞:新鮮樣品或-70℃保存樣品,避免反復凍融提供樣品量105以上植物:提供樣品量500mg以上(新鮮葉片,或4℃保存一周內(nèi)的葉片),剩下歸還(新鮮組織,植物干粉得率較低)
原核生物:提供樣品量108CFU或者0.5個麥氏單位以上(非致病性,提供菌株和培養(yǎng)基信息;致病性,提供滅活菌液等)
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得到基因組DNA,純度(OD260/OD280=1.6-1.8),提供基因組凝膠電泳照片。
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10-49個
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80元/個
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50個以上
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50元/個
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基因組RNA提取
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1-9個
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300元/個
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組織:新鮮樣品或-70℃保存樣品,避免反復凍融提供樣品量500mg以上,剩下歸還(無致病性,除脂肪組織、粘液狀組織以外)。
細胞:新鮮樣品或-70℃保存樣品,避免反復凍融提供樣品量105以上
植物:提供樣品量500mg以上(要新鮮葉片,或4℃保存一周內(nèi)的葉片),剩下歸還。
原核生物:提供樣品量108CFU或者0.5個麥氏單位以上
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得到RNA純度(OD260/OD280=1.8-2.0)條帶清晰,提供電泳照片,無基因組污染。
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10-19個
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200元/個
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20-49個
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160元/個
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50個以上
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100元/個
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反轉(zhuǎn)錄
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1-9個
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300元/個
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提供純化好的、未降解的總RNA 5μg
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cDNA,提供40μl,2μl夠用一次反轉(zhuǎn)錄時oligo dT和Random Primer客戶任選
PCR檢測采用內(nèi)參引物。
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10-19個
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200元/個
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20-49個
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160元/個
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50個以上
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100元/個
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PCR條件優(yōu)化(TagMan法)
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600元/個
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PCR條件優(yōu)化(SybrGreen法)
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400元/個
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PCR反應
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1-9個
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40元/個
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客戶提供模板和引物,并告知濃度、產(chǎn)物大小等信息。
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與模板和引物相關(guān)。
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10-49個
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30元/個
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50-100個
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10元/個
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100個以上
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6元/個
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質(zhì)粒構(gòu)建
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600元/次
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RT-PCR反應
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1-3個
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240元/個
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客戶按要求提供試驗樣本(詳見基因組DNA提取、基因組RNA提取和反轉(zhuǎn)錄樣品要求);或提供純化好的DNA樣品5μg
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4-19個
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200元/個
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20個以上
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160元/個
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50個以上
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100元/個
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注:1、以上技術(shù)服務報價是針對Human、Mouse、Rat三種生物種的報價。如果是三種生物種以外的物種時,價格請具體垂詢!
2、如因非本公司原因造成某實驗步驟失敗,使實驗提前終止,已啟動的實驗項目仍正常收費。
3、內(nèi)參的GAPDH和β-actin引物探針免費,標準曲線免費贈送。
4、內(nèi)參:哺乳動物內(nèi)參還有 GAPDH基因和β-actin基因。細菌內(nèi)參16S rDNA基因,植物的內(nèi)參為actin基因。
4、內(nèi)參:哺乳動物內(nèi)參還有 GAPDH基因和β-actin基因。細菌內(nèi)參16S rDNA基因,植物的內(nèi)參為actin基因。